Formation de paillasse : diagnostic avancé et séquençage du virus de la peste porcine africaine

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The Director of the OVRI (and WOAH Expert) Dr Misheck Mulumba, delivering his welcome address. Picture (c) P. Bastiaensen (woah) 2023.

Le Directeur de l’OVRI (et Expert de l’OMSA), le Dr Misheck Mulumba, prononçant son discours de bienvenue. Photo (c) P. Bastiaensen (omsa) 2023.

 

Suite à un sondage sur les capacités des laboratoires menée en avril 2023, sept laboratoires nationaux de référence avaient été invités à bénéficier d’une formation pratique d’une semaine sur le diagnostic avancé et le séquençage moléculaire du virus de la peste porcine africaine (PPA) au Laboratoire de Référence de l’OMSA pour la PPA, situé à l’Institut de Recherches Vétérinaires d’Onderstepoort (Onderstepoort Veterinary Research Institute, OVRI) à Pretoria, en Afrique du Sud (Expert désigné : Dr Livio Heath).

Les pays bénéficiaires étaient le Botswana, le Bénin, le Mali, le Maroc, le Nigeria, le Sénégal et la Tanzanie. Ces pays disposent soit de procédures déjà bien établies pour le diagnostic de base de la peste porcine africaine, soit des capacités globales et l’infrastructure nécessaires pour commencer à diagnostiquer la peste porcine africaine à la suite de la formation.

La majeure partie de la formation s’est déroulée dans l’installation pour maladies animales transfrontalières (transboundary animal diseases, TAD), un centre à haut niveau de confinement située à environ 500 mètres du campus principal, où plusieurs agents pathogènes, dont beaucoup sont étrangers au pays, sont manipulés dans des conditions BSL-3.

Outre un grand nombre de conférences sur la peste porcine africaine et les techniques de diagnostic recommandées, une formation pratique a été dispensée sur les thèmes suivants :

l’isolement des virus et le diagnostic moléculaire

  • Techniques aseptiques de culture cellulaire
  • Traitement des échantillons et extraction manuelle de l’ADN
  • Extraction automatisée de l’ADN et l’utilisation d’un équipement PCR portable pour les tests de proximité (pen-side tests)
  • PCR en temps réel
  • Méthodes alternatives de collecte d’échantillons
  • Vecteurs de la peste porcine africaine et keur surveillance
  • PCR conventionnel pour la caractérisation génétique
  • Nettoyage du PCR
  • Sérologie de la peste porcine africaine (ELISA et dispositifs à flux latéral, lateral flow devices)

Analyse de séquences et phylogénétique

  • Séquençage, analyse de séquences et phylogénétique

La formation fait partie de la mise en place d’un réseau plus élargi de laboratoires de référence internationaux, ainsi que de laboratoires de service régionaux (laboratoires de référence nationaux non accrédités par la FAO ou l’OMSA mais souhaitant desservir la sous-région). Afin d’évaluer la capacité des 7 laboratoires à mener les protocoles de diagnostic dans leurs propres installations, la formation actuelle sera suivie d’une série de tests de comparaison inter-laboratoire, coordonnés par l’OVRI dans les semaines à venir.

The participants from Senegal (left) and Bénin (right). Picture © P. Bastiaensen (woah) 2023.

Les participantes du Sénégal (à gauche) et du Bénin (à droite). Photo © P. Bastiaensen (omsa) 2023.

Remerciements

Cette formation a été rendue possible grâce au soutien technique de ARC-OVRI (Afrique du Sud) et CSIRO (Australie)

Manuel Terrestre

PPA

Chapitre 3.9.

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